"Темний Дворецький: Книга Атлантики" — це продовження популярного аніме "Темний Дворецький", яке розповідає про пригоди сімейства Фантомхайв, зокрема, молодого героя Сіела та його демонічного дворецького Себастьяна Міхаеліса. У цій новій частині вони вирушають у подорож на океанське дно, де розгортається загадкова історія з потопленим містом Атлантида. Підводний світ наповнений таємницями, небезпекою і новими ворогами, а Сіел і Себастьян повинні використати свої здібності, щоб розкрити загадку і врятувати себе від небезпеки.

Ґран – звичайний хлопець, життя якого кардинально змінилося миттєво. Він живе на літаючому острові Зінкенстілл і товаришує з балакучою ящіркою. Якось він помічає таємниче свічення у лісі і вирішує досліджувати. У результаті він зустрічає Лурію, загадкову дівчину із надприродними здібностями, яку переслідують солдати Імперії Ерст. Тепер Лурія та її соратники, включаючи лейтенанта Каталіну, готові битися з ворогами.

В засміченій квартирі, 24-ох річний Тендо Акіра дивиться кіно про зомбі пустим трохи заздрісним поглядом. Після трьох важких років рабської праці на корпорацію в Японії, він абсолютно виснажений. Він навіть не може набратись сміливості, щоб зізнатись в коханні прекрасній співробітниці Оторі. Одного ранку він натрапляє на свого орендодавця, який виявляється кимось зовсім іншим. Все місто кишить зомбі, а Акіра, тікаючи та рятуючи своє життя, ще ніколи не почувався таким живим!

Сьогодні день народження Тецуї Куроко. Щоб відсвяткувати його, Сацукі Момої запросила інших членів "Покоління чудес" пограти в баскетбол разом і оживити ностальгічні спогади про шкільні роки. Тим часом Тайґа Каґамі та його товариші по команді зі школи Сейрін роблять усе можливе, щоб підготуватися до дня народження Куроко.

У навчальному закладі "Академія ісланд" рейтинг успішності учнів залежить від ігор й чим ти кращий тим більше зірок ти отримуєш. Недавно переведений учень Хірото перемагає найкращу ученицю та стає першим, через це в академії починаються найзатятіші ігри про першість.

У центрі сюжету - сільський хлопчина Тацумі, який разом із друзями вирушив на підкорення імперської столиці заради того, щоб допомогти рідному селищу. Але, на жаль, серце імперії давно прогнило і через дитину-імператора править міністр, який встановив свої порядки в імперії. Місто тероризує банда "Нічний рейд", яка й напала на родину аристократів, що прихистила Тацумі. Проте милі господарі виявилися садистами, які заманюють наївних провінціалів, а друзі героя давно померли в їхньому підвалі. Тацумі власними руками помстився за друзів, і тепер має лиш один шлях - до банди.