"Євангеліон у Школі" це пародія на "Євангеліон Нового Покоління", в якій всі персонажі оригінального серіалу стають учнями середньої школи в Токіо-3. Серіал представляє три "Сестри Рей": перша Рей молодша, ніж інші учасники, друга схожа на ту Рей яку глядачі бачили в оригінальному серіалі і образ третьої Рей базується на активній і незвичній "Альтернативній Рей" зі снів в останній серії оригінального серіалу. Більш того, EVA-01 робот також відвідує цю школу, але виглядає як невеликий робот розміром із зріст людини.

Два міста-побратими під назвою Отова знаходяться в різних півкулях... В одному місті розгортається звична різдвяна історія – старшокласник Хіро пішов з дому та живе один, заробляючи малювання манґи. Такій творчій натурі, як він потрібна жіноча опіка, в чому впевнена Кей, подруга дитинства героя. Ій зовсім не подобається, що "братик" потрапив до рук вродливої однокласниці Міяко, тут іще й якийсь Цуцумі, фанат кіномистецтва, докучає їй, а подруга Мізукі тільки й хочу, що мінятися шьоджьо-манґою. Яка там манґа, коли "братика" відбивають?! А на іншому кінці світу, де вічне літо, мрійника Ренджі доля зводить із дивною дівчинкою з пов'язкою на лівому оці. Але після приємної бесіди наступного дня він чує від неї: «Вибач, а ми вже зустрічалися?». З Чіхіро, його новою знайомою, сталася біда. Допомогти ій не може ніхто, навіть таємний опікун Хімура, який наче б то володіє владою та знаннями...

Це історія про протиборство стихій вогню і вітру. Казума із клану Каннаґі - сильнішого клану чаклунів вогню не справився із довіреною йому силою вогню, був переможений в поєдинку своєї двоюрідною сестрою Аяно, яка оволоділа силою вогню, і був вигнаний із клану. Через 4 роки він повернувся, але вже з іншим прізвищем і досконало володіючи стихією вітру. Водночас з його поверненням починають відвуватися таємничі вбивства - трьох членів клану Каннаґі було вбито могутнім чаклуном вітру. Підозра падає тільки на Казуму, якого звинувачують в спробі помститися за вигняння, він безуспішно намагається виправдатися, але вже пізно, війну розв'язано. Хто на чиєму боці? Хто видає себе за іншого? До чого може призвести ця війна? Хто стоїть за усіма подіями?

Історія гарна та легка, як сон. Історія кохання, знайти яке можна лиш пройшовши неіснуючою вулицею, слідуючи за несправжнім вказівником. Ця історія закінчується, ледь почавшись, але кохання можна повернути. Навіть через багато років... Також можна повернути час, якщо ти пам'ятаєш мелодію своєї юності, чи повернути на небо веселку, якщо тільки зможеш заспівати її пісню...

Це історія про двох закоханих, які мали невдачі в коханні. Чізуру іноді трохи незграбна та не стримана. Всі її хлопці йшли від неї, іноді, здавалося б, по дивним обставинам, і дівчина вже втратила надію знайти свою любов. Юдай занадто боязкий, щоб слово проти сказати, весь час мовчить та червоніє, хоч і намагається перебороти себе - все безуспішно. Сьогодні у них побачення, на яке в обох грандіозні плани. Чізуру вирішила розлучитися з коханим, адже він ні разу не сказав їй про свої почуття, навіть коли вона зізнавалася йому в любові. А любов без взаємності не принесе ніякого щастя. Юдай ж, навпаки, весь ранок налаштовувався закріпити їх відносини: він готовий вимовити три заповітних слова улюбленої і піднести їй подарунок. Правда, в зоомагазині куплений ним білий пухнастий кролик для коханої раптово став карликовий осликом, точніше, ослик захотів помінятися з ним місцями. В результаті...

Вчені використали всі свої можливості для того, аби воскресити суперницю науки - магію. Результат виявився приголомшливим. Відроджена магія тепер використовується скрізь - у медицині, на виробництві, у збройних силах. Проте за все доводиться платити. За прорив в економіці людство розплачується багаточисельними зловживаннями (або необережними вживаннями) магічних можливостей. Так виникають монстри, приборкати і знищити яких можуть тільки бойові маги. В народі їх назвали "гамівними сорочками".

Шінджі Ікарі отримує дзвінок від батька з офісу NERV — організації, що воює з таємничим ворогом. Остання надія людства у цій війні — євангеліон. Це людиноподібна зброя, і за велінням долі чомусь саме Шінджі, замкненому юнакові, що страждає психологічними проблемами, судилось стати його пілотом…