Головний герой, навісний божевільний вчений, створює машину часу. Але не все так просто у нашому світі. СЕРН намагається перешкодити в оприлюдненні цієї інформації, оскільки володіє ексклюзивними правами на цей винахід. Починається полювання, і наш герой втрачає подругу. Аби повернути її, він мусить змінити плин часу і переписати історію. Увага! Додані серії ONA та OVA "Відкриття загубленої ланки. Ділення на 0. β-лінія. Серія 23" (Початок історії другого сезону - Steins;Gate0. Альтернативний епізод 23-ої серії першого сезону.)

Зазвичай люди не помічають, як спливає час. Минув рік з тих подій, що були у серіалі. Лабораторія досі працює, а Окарін меле дурниці. Проте, одного дня у нього знову почалися напади "Інтерпретації Штейнера". Однак, ні машини часу, ні Д-мейлів не було... Все знову повторюється... Виникає враження, ніби це дежавю...