Аніме оповідає про пригоди дівчинки Сіти, чиє справжнє ім'я Люсіта Тоель Ур Лапута і хлопчика Пазу. Сіта є нащадком стародавнього монархічного роду, але живе як звичайна дівчинка. Однак коли їм доводиться рятуватися від піратів та військових Сіте доводиться згадати своє минуле. Як виявляється Сіта і Пазу, пірати, військові і далекий родич Сіти прагнуть знайти стародавній літаючий замок Лапута. Але тільки Сіта має чарівну медальйонім, який вказує потрібний напрямок.