Сюжет: Ю Таґамі, син відомого науковця, який зник за невідомих обставин, досліджуючи загадковий острів Новий Остраль, отримує листа із запрошенням приєднатися до нової експедиції на цей острів. Але він не знає, що даний острів ховає велику таємницю, за якою також полює Корпорація ҐАЙЛ...

Після Джабуро Сили Земної Федерації планують операцію по захопленню Одеси, штабу Зеонських ударних сил. «Біла база» прямує до Белфаста для поповнення запасів. Проте вона отримує новий наказ: відправитися на острів, відомий як «Острів, з якого ніхто не повертався». Повнометражка базується на 15му епізоді оригінального серіалу.

Однолітня Війна між Федерацією та Зіоном підходить до свого завершення, знову перемістившись у космос. Амуро Рей починає розуміти та використовувати свої здібності Ньютайпа. На його шляху стає Червона Комета Шар Азнабль та загадкова дівчина Лала Суне́, яка знає відповіді на всі його запитання. Чи зможе Федерація перемогти Зіон? Чи зможе Шар довести, що він кращий Ньютайп, ніж Амуро? На ці запитання дасть відповідь завершальна частина трилогії...

Війна між Земною Федерацією та Герцогством Зіон продовжується, тепер вже на Землі. Пілот Ґандаму Амуро Рей починає краще розуміти всі жахи війни після протистоянь із одним із асів Зіону Рамбою Ралем та його мобільним костюмом - Ґуф.

Минуло 79 років, з того часу, коли більша частина людства почала жити на орбітальних космічних колоніях. Ось уже шість місяців, як йде війна між владою Земної Федерації та однією із груп колоній - Герцогством Зіон. 15-літній хлопець, Амуро Рей, знаходить новітню зброю Федерації, яка може змінити хід війни... Перша частина (з трьох) адаптації однойменного аніме-серіалу 1979 року.