Напівофіційна організація охоронців громадського порядку “Білий хрест”, члени якої винищують світове зло за допомогою холодної зброї та вибухівки, а на дозвіллі роздумують про помилки власного минулого, займаються розслідуванням серії загадкових самогубств в одній елітній академії десь на японських островах. З’ясовується, що самогубства — побічний ефект діяльності якоїсь зловмисної організації, яка по всьому світу перетворює прогресивне юнацтво в вельми ефективних зомбі; тим часом господарем цих зомбі повинен стати бог у плоті — людиноподібна істота, що вирощується в найглибшому підвалі тієї самої школи, звідки веде своє розслідування “Білий хрест”.

Уся родина 15-річного Рюджі Кісарагі - мисливці за скарбами. Не дивно, що рідня героя у вічних експедиціях, і хлопець спокійно живе один, не звертаючи, до речі, уваги на почуття скромної однокласниці Місакі Ето. Спокійне життя скінчилася з приїздом з Америки старшої кузини на ім'я Еріко Нанао, паливоди навіть за сімейними мірками. Посеред літніх канікул Еріко, дівчина з видатним інтелектом й іншими достойностями, підбила Рюджі викрасти валізу з цінним вантажем з-під носа у банди Ікол - людей вельми серйозних. У перебігу погоні й перестрілки валіза відкрилася і явила світові... чарівне юне створіння! Утікши від бандитів, молоді авантюристи з'ясували три речі - по-перше, їм дісталася дівчинка-дракон, зовні схожа на восьмирічну дитину, а розумом - на немовля. По-друге, вона звідкись знає і дуже любить Рюджі - власне, його ім'я і становить весь її нехитрий словниковий запас. По-третє, давши...

Шінджі Ікарі отримує дзвінок від батька з офісу NERV — організації, що воює з таємничим ворогом. Остання надія людства у цій війні — євангеліон. Це людиноподібна зброя, і за велінням долі чомусь саме Шінджі, замкненому юнакові, що страждає психологічними проблемами, судилось стати його пілотом…

Одного дня Макото мала загинути від нещасного випадку, але раптом виявилось, що у неї є дивовижна здатність переноситись (стрибати) назад у часі і змінювати плин подій. Це рятує її життя і ставить його з ніг на голову. Тепер вона стрибає, як їй заманеться, і змінює все, що їй не подобається. Але чи справді ці зміни на краще?