В одному з мегаполісів Японії, де життя тече дуже стрімко, відбулося незрозуміле: зникло все населення міста. Ця подія ставить уряд країни на вуха. Головним героєм є хлопчина Такуя - самотній кур'єр, який працює за контрактом на дослідницьку організацію. Одного разу він зустрічає дівчину Юкі, яка є єдиною, хто вижив після того інциденту. Вона вважає, що подія якось пов'язана з посланням її батька, який теж безслідно зник. Парочка вирішує відправитися в те місто-привид і дізнатися таємницю зникнення людей. Проте не все так просто. На шляху розслідування їм зустрінуться не лише перешкоди у вигляді змов секретних організацій, але й зіткнення з примарами, які давно мали піти в інший світ, але все ще живуть в цьому місці.