Події відбуваються в епоху, коли самураї правили Японією. Якось усі столичні Шінсенґумі були перебиті невідомим нападником, залишивши по собі лише одного вцілілого воїна. Тому задля захисту безпеки у Кіото було здійснено надсекретну операцію, в результаті якої полеглих воїнів замінили на сімох, уже колишніх, злочинців.

У цьому світі існують люди, які можуть проникати в розум людини й маніпулювати її спогадами. Такі особи дуже цінуються в кримінальному світі, оскільки їх вміло використовують у брудних справах. Але у цієї сили є й зворотний бік: якщо часто її використовувати, власник втрачає частина спогадів, і розум руйнується. Через страх і зневагу стосовно цих людей їх назвали “тваринками”.

У війні з тероризмом Сараєво було знищено ядерним пристроєм. За громадянами провідних країн демократичного устрою було встановлено тотальне стеження, а країни, що розвивалися, накрило хвилями геноциду. Вважається, що за знищенням світової системи стоїть таємничий американець Джон Пол. Тому завдання агенту розвідки Клавісу Шепарду – вистежити Джона Пола серед уламків цивілізації і знайти справжнє серце пітьми – орган геноциду.