У майбутньому межа між цифровим і фізичним світами помітно стерлася, кібертроніка змінила життя людства до невпізнанності, створивши новий синтетичний рівень існування й звівши людей у єдину Мережу. Однак зближення живих організмів і машин виявилося обтяжене найнебезпечнішими наслідками, надавши зловмисникам небачені досі можливості маніпулювання людською свідомістю. Для запобігання подібним технозлочинам і був створений Дев'ятий Відділ. Цей елітний підрозділ поліції сканує як фізичний, так і кібернетичний світи для виявлення шкідливої діяльності хакерів, кібер-терористів і машин, що сказилися. У випадку необхідності затримання злочинців вирушає оперативна група професіоналів, кожен зі членів якої має особливі якості. Бато, людина, начинена електронікою, має сталеві очі й потужні біцепси з титаніуму. Детектив Тогуса, людина без будь-яких кібер-додатків, збагачує команду своєю ірраціональною інтуіцією. Веде групу непереборна Матоко Кусанагі, напівкіборг-напівлюдина. Коли в дії така блискуча група, яку в політичній сфері прикриває шеф Дев'ятого Відділу Арамакі й споряджена вражаючими військовими технологіями, світ може спати спокійно.