Гайвер — це іншопланетна біо-зброя, котра при злитті з носієм, багатократно збільшує його силу та здібності. На планеті існує корпорація Кронос, яка займається створенням зоаноїдів (монстрів, вирощених на основі людського організму). Боси корпорації дізналися, що на Землі існує три гайвер-юніта і знайшли їх. Але один з тестових зоаноїдів краде юніти і намагається скритися з ними. Зоаноїди, яких відправили на пошуки втікача, знаходять його, але потрапляють у засідку. В результаті вибуху гайвер-юніти розлітаються і один з них потрапляє до рук 17-річного школяра Шьо Фукамачі.